Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpargP37238 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpargP37238 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpargP37238 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PpargP37238 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpargP37238 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpargP37238 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpargP37238 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpargP37238 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpargP37238 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpargP37238 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpargP37238 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpargP37238 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PpargP37238 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpargP37238 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpargP37238 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpargP37238 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpargP37238 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpargP37238 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpargP37238 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpargP37238 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PpargP37238 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpargP37238 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpargP37238 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpargP37238 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpargP37238 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpargP37238 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PpargP37238 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpargP37238 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpargP37238 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpargP37238 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PpargP37238 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpargP37238 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpargP37238 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpargP37238 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PpargP37238 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpargP37238 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpargP37238 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpargP37238 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PpargP37238 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpargP37238 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PpargP37238 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PpargP37238 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PpargP37238 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpargP37238 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpargP37238 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PpargP37238 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpargP37238 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpargP37238 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PpargP37238 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpargP37238 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpargP37238 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpargP37238 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpargP37238 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpargP37238 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpargP37238 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpargP37238 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpargP37238 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpargP37238 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpargP37238 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PpargP37238 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpargP37238 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpargP37238 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpargP37238 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpargP37238 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpargP37238 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpargP37238 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PpargP37238 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpargP37238 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpargP37238 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpargP37238 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpargP37238 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpargP37238 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpargP37238 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpargP37238 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpargP37238 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpargP37238 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpargP37238 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpargP37238 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PpargP37238 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpargP37238 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpargP37238 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpargP37238 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpargP37238 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpargP37238 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpargP37238 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpargP37238 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpargP37238 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PpargP37238 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PpargP37238 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PpargP37238 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PpargP37238 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PpargP37238 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PpargP37238 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PpargP37238 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PpargP37238 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpargP37238 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpargP37238 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpargP37238 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpargP37238 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 476.1 ms