Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptpn1P35821 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptpn1P35821 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptpn1P35821 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptpn1P35821 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptpn1P35821 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms