Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ercc5P35689 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ercc5P35689 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ercc5P35689 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ercc5P35689 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc5P35689 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc5P35689 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc5P35689 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc5P35689 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc5P35689 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc5P35689 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc5P35689 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc5P35689 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc5P35689 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms