Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rfc1P35601 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rfc1P35601 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfc1P35601 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms