Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Grin2aP35436 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Grin2aP35436 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Grin2aP35436 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Grin2aP35436 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms