Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PpardP35396 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PpardP35396 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PpardP35396 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PpardP35396 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PpardP35396 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PpardP35396 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PpardP35396 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PpardP35396 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PpardP35396 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PpardP35396 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PpardP35396 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PpardP35396 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PpardP35396 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PpardP35396 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PpardP35396 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PpardP35396 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PpardP35396 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PpardP35396 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpardP35396 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpardP35396 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpardP35396 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpardP35396 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpardP35396 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpardP35396 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpardP35396 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpardP35396 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpardP35396 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpardP35396 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpardP35396 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpardP35396 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpardP35396 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpardP35396 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpardP35396 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpardP35396 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpardP35396 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PpardP35396 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpardP35396 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpardP35396 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpardP35396 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PpardP35396 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PpardP35396 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PpardP35396 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PpardP35396 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PpardP35396 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PpardP35396 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PpardP35396 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PpardP35396 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PpardP35396 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PpardP35396 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PpardP35396 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PpardP35396 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PpardP35396 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PpardP35396 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PpardP35396 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PpardP35396 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PpardP35396 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PpardP35396 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PpardP35396 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PpardP35396 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PpardP35396 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PpardP35396 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PpardP35396 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PpardP35396 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PpardP35396 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PpardP35396 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PpardP35396 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PpardP35396 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PpardP35396 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PpardP35396 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PpardP35396 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PpardP35396 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PpardP35396 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PpardP35396 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PpardP35396 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PpardP35396 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PpardP35396 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PpardP35396 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PpardP35396 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PpardP35396 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PpardP35396 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PpardP35396 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PpardP35396 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PpardP35396 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PpardP35396 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PpardP35396 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PpardP35396 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PpardP35396 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PpardP35396 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PpardP35396 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PpardP35396 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PpardP35396 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PpardP35396 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PpardP35396 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PpardP35396 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PpardP35396 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PpardP35396 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpardP35396 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpardP35396 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpardP35396 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms