Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn11P35235 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn11P35235 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn11P35235 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms