Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptk2P34152 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ptk2P34152 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptk2P34152 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms