Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdh15P33146 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh15P33146 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh15P33146 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms