Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Saa4P31532 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Saa4P31532 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Saa4P31532 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Saa4P31532 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms