Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa11P31311 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxa11P31311 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa11P31311 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms