Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col2a1P28481 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col2a1P28481 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col2a1P28481 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col2a1P28481 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms