Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde6aP27664 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pde6aP27664 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pde6aP27664 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms