Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RdxP26043 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RdxP26043 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RdxP26043 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RdxP26043 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RdxP26043 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RdxP26043 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RdxP26043 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RdxP26043 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RdxP26043 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RdxP26043 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RdxP26043 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RdxP26043 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RdxP26043 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RdxP26043 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RdxP26043 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RdxP26043 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RdxP26043 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RdxP26043 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RdxP26043 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RdxP26043 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RdxP26043 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RdxP26043 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RdxP26043 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RdxP26043 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RdxP26043 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RdxP26043 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RdxP26043 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RdxP26043 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RdxP26043 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RdxP26043 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RdxP26043 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RdxP26043 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RdxP26043 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RdxP26043 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RdxP26043 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RdxP26043 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RdxP26043 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RdxP26043 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RdxP26043 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RdxP26043 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RdxP26043 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RdxP26043 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RdxP26043 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RdxP26043 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RdxP26043 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RdxP26043 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RdxP26043 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RdxP26043 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RdxP26043 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RdxP26043 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RdxP26043 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RdxP26043 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RdxP26043 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RdxP26043 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RdxP26043 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RdxP26043 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RdxP26043 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RdxP26043 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RdxP26043 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RdxP26043 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RdxP26043 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RdxP26043 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RdxP26043 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RdxP26043 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RdxP26043 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RdxP26043 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RdxP26043 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RdxP26043 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RdxP26043 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RdxP26043 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RdxP26043 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RdxP26043 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RdxP26043 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms