Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb7P26011 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb7P26011 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb7P26011 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms