Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh1a1P24549 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Aldh1a1P24549 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a1P24549 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms