Protein–RNA interactions for Protein: P23798

Pcgf2, Polycomb group RING finger protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf2P23798 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf2P23798 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcgf2P23798 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms