Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf8P23611 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf8P23611 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf8P23611 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf8P23611 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf8P23611 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf8P23611 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irf8P23611 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf8P23611 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms