Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RarbP22605 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RarbP22605 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RarbP22605 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RarbP22605 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RarbP22605 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RarbP22605 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RarbP22605 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RarbP22605 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RarbP22605 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RarbP22605 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RarbP22605 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RarbP22605 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RarbP22605 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RarbP22605 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RarbP22605 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RarbP22605 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RarbP22605 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RarbP22605 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RarbP22605 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RarbP22605 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RarbP22605 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RarbP22605 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RarbP22605 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RarbP22605 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RarbP22605 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RarbP22605 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RarbP22605 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RarbP22605 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RarbP22605 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RarbP22605 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RarbP22605 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RarbP22605 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RarbP22605 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RarbP22605 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RarbP22605 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RarbP22605 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RarbP22605 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RarbP22605 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RarbP22605 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RarbP22605 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RarbP22605 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RarbP22605 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RarbP22605 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RarbP22605 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RarbP22605 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RarbP22605 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RarbP22605 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RarbP22605 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RarbP22605 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RarbP22605 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RarbP22605 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RarbP22605 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RarbP22605 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RarbP22605 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RarbP22605 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RarbP22605 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RarbP22605 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RarbP22605 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RarbP22605 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RarbP22605 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RarbP22605 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RarbP22605 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RarbP22605 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RarbP22605 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RarbP22605 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RarbP22605 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RarbP22605 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RarbP22605 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RarbP22605 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RarbP22605 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RarbP22605 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RarbP22605 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RarbP22605 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RarbP22605 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RarbP22605 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RarbP22605 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RarbP22605 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RarbP22605 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RarbP22605 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RarbP22605 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RarbP22605 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RarbP22605 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RarbP22605 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RarbP22605 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RarbP22605 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RarbP22605 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RarbP22605 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RarbP22605 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RarbP22605 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RarbP22605 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RarbP22605 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RarbP22605 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RarbP22605 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RarbP22605 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RarbP22605 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RarbP22605 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RarbP22605 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RarbP22605 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RarbP22605 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms