Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn1P22387 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn1P22387 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn1P22387 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn1P22387 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn1P22387 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn1P22387 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn1P22387 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn1P22387 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn1P22387 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn1P22387 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Edn1P22387 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Edn1P22387 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn1P22387 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn1P22387 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn1P22387 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn1P22387 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn1P22387 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Edn1P22387 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn1P22387 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn1P22387 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn1P22387 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edn1P22387 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms