Protein–RNA interactions for Protein: P20029

Hspa5, 78 kDa glucose-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa5P20029 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hspa5P20029 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hspa5P20029 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hspa5P20029 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hspa5P20029 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hspa5P20029 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hspa5P20029 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hspa5P20029 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hspa5P20029 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Hspa5P20029 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hspa5P20029 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hspa5P20029 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hspa5P20029 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms