Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnnc1P19123 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnnc1P19123 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnnc1P19123 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms