Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka1P18653 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps6ka1P18653 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps6ka1P18653 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms