Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb1P17919 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb1P17919 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms