Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrphP15331 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrphP15331 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrphP15331 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrphP15331 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrphP15331 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrphP15331 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrphP15331 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrphP15331 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrphP15331 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrphP15331 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrphP15331 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrphP15331 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrphP15331 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrphP15331 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrphP15331 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrphP15331 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PrphP15331 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrphP15331 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrphP15331 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrphP15331 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrphP15331 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrphP15331 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PrphP15331 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrphP15331 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrphP15331 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrphP15331 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrphP15331 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PrphP15331 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrphP15331 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrphP15331 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrphP15331 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PrphP15331 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrphP15331 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrphP15331 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrphP15331 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrphP15331 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrphP15331 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrphP15331 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrphP15331 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrphP15331 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrphP15331 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrphP15331 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrphP15331 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrphP15331 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrphP15331 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrphP15331 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PrphP15331 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrphP15331 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrphP15331 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrphP15331 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrphP15331 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrphP15331 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrphP15331 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrphP15331 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrphP15331 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrphP15331 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrphP15331 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrphP15331 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrphP15331 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrphP15331 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrphP15331 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrphP15331 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrphP15331 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrphP15331 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrphP15331 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrphP15331 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrphP15331 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrphP15331 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrphP15331 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrphP15331 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrphP15331 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrphP15331 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrphP15331 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PrphP15331 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrphP15331 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrphP15331 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrphP15331 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrphP15331 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrphP15331 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrphP15331 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrphP15331 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrphP15331 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrphP15331 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrphP15331 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrphP15331 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrphP15331 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrphP15331 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrphP15331 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrphP15331 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrphP15331 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrphP15331 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrphP15331 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PrphP15331 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrphP15331 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PrphP15331 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrphP15331 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrphP15331 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrphP15331 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrphP15331 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms