Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmnb1P14733 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmnb1P14733 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmnb1P14733 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lmnb1P14733 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmnb1P14733 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmnb1P14733 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmnb1P14733 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmnb1P14733 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmnb1P14733 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmnb1P14733 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms