Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb1P13372 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb1P13372 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms