Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nr4a1P12813 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nr4a1P12813 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nr4a1P12813 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms