Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calb1P12658 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calb1P12658 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calb1P12658 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calb1P12658 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calb1P12658 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calb1P12658 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calb1P12658 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calb1P12658 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calb1P12658 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Calb1P12658 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calb1P12658 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calb1P12658 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms