Protein–RNA interactions for Protein: P12656

Tshb, Thyrotropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TshbP12656 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TshbP12656 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TshbP12656 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TshbP12656 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TshbP12656 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TshbP12656 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TshbP12656 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TshbP12656 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TshbP12656 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TshbP12656 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TshbP12656 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TshbP12656 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TshbP12656 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TshbP12656 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TshbP12656 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TshbP12656 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TshbP12656 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TshbP12656 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TshbP12656 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TshbP12656 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TshbP12656 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TshbP12656 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TshbP12656 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TshbP12656 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TshbP12656 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TshbP12656 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TshbP12656 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TshbP12656 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TshbP12656 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TshbP12656 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TshbP12656 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TshbP12656 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TshbP12656 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TshbP12656 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TshbP12656 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TshbP12656 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TshbP12656 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TshbP12656 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TshbP12656 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TshbP12656 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TshbP12656 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TshbP12656 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TshbP12656 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TshbP12656 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TshbP12656 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TshbP12656 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TshbP12656 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TshbP12656 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TshbP12656 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TshbP12656 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TshbP12656 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TshbP12656 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TshbP12656 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TshbP12656 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TshbP12656 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TshbP12656 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TshbP12656 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TshbP12656 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TshbP12656 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TshbP12656 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TshbP12656 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TshbP12656 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TshbP12656 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TshbP12656 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TshbP12656 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TshbP12656 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TshbP12656 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TshbP12656 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TshbP12656 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TshbP12656 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TshbP12656 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TshbP12656 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TshbP12656 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TshbP12656 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TshbP12656 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms