Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga5P11688 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga5P11688 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga5P11688 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga5P11688 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga5P11688 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga5P11688 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga5P11688 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga5P11688 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Itga5P11688 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Itga5P11688 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga5P11688 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga5P11688 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga5P11688 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms