Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lamp1P11438 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamp1P11438 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamp1P11438 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms