Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RaraP11416 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RaraP11416 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RaraP11416 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RaraP11416 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RaraP11416 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RaraP11416 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RaraP11416 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RaraP11416 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RaraP11416 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RaraP11416 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RaraP11416 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RaraP11416 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RaraP11416 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RaraP11416 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RaraP11416 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RaraP11416 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RaraP11416 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RaraP11416 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RaraP11416 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RaraP11416 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RaraP11416 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RaraP11416 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaraP11416 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaraP11416 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaraP11416 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RaraP11416 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaraP11416 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaraP11416 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaraP11416 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaraP11416 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaraP11416 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RaraP11416 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RaraP11416 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RaraP11416 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RaraP11416 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RaraP11416 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RaraP11416 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RaraP11416 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RaraP11416 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RaraP11416 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RaraP11416 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RaraP11416 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaraP11416 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaraP11416 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaraP11416 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaraP11416 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaraP11416 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaraP11416 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaraP11416 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaraP11416 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaraP11416 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaraP11416 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaraP11416 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RaraP11416 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RaraP11416 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RaraP11416 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RaraP11416 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RaraP11416 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RaraP11416 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RaraP11416 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RaraP11416 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RaraP11416 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RaraP11416 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RaraP11416 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaraP11416 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaraP11416 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaraP11416 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaraP11416 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaraP11416 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaraP11416 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaraP11416 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RaraP11416 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms