Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv4P11370 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv4P11370 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fv4P11370 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv4P11370 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv4P11370 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fv4P11370 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fv4P11370 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms