Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcl2P10889 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cxcl2P10889 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cxcl2P10889 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl2P10889 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl2P10889 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl2P10889 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl2P10889 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl2P10889 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl2P10889 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl2P10889 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxcl2P10889 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms