Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd4P10628 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxd4P10628 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms