Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsbP10605 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsbP10605 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsbP10605 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsbP10605 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsbP10605 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsbP10605 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsbP10605 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms