Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Becn2P0DM65 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Becn2P0DM65 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Becn2P0DM65 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms