Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd3P09027 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd3P09027 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms