Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc8P09025 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc8P09025 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc8P09025 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms