Protein–RNA interactions for Protein: P08152

Egr2, E3 SUMO-protein ligase EGR2, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr2P08152 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr2P08152 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr2P08152 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr2P08152 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Egr2P08152 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms