Protein–RNA interactions for Protein: P06909

Cfh, Complement factor H, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfhP06909 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CfhP06909 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CfhP06909 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CfhP06909 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CfhP06909 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CfhP06909 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CfhP06909 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CfhP06909 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CfhP06909 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CfhP06909 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CfhP06909 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CfhP06909 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CfhP06909 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CfhP06909 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CfhP06909 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CfhP06909 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CfhP06909 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CfhP06909 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CfhP06909 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CfhP06909 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CfhP06909 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CfhP06909 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CfhP06909 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CfhP06909 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CfhP06909 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CfhP06909 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CfhP06909 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CfhP06909 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CfhP06909 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CfhP06909 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CfhP06909 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CfhP06909 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CfhP06909 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CfhP06909 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CfhP06909 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CfhP06909 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CfhP06909 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CfhP06909 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CfhP06909 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CfhP06909 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CfhP06909 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CfhP06909 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CfhP06909 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CfhP06909 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CfhP06909 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CfhP06909 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CfhP06909 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CfhP06909 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CfhP06909 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CfhP06909 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CfhP06909 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CfhP06909 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CfhP06909 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CfhP06909 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CfhP06909 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CfhP06909 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CfhP06909 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CfhP06909 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CfhP06909 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CfhP06909 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CfhP06909 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CfhP06909 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CfhP06909 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CfhP06909 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CfhP06909 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CfhP06909 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CfhP06909 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CfhP06909 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CfhP06909 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CfhP06909 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CfhP06909 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CfhP06909 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CfhP06909 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CfhP06909 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CfhP06909 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CfhP06909 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CfhP06909 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CfhP06909 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CfhP06909 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CfhP06909 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CfhP06909 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CfhP06909 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CfhP06909 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CfhP06909 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CfhP06909 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CfhP06909 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CfhP06909 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CfhP06909 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CfhP06909 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CfhP06909 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CfhP06909 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CfhP06909 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CfhP06909 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CfhP06909 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CfhP06909 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CfhP06909 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CfhP06909 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CfhP06909 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CfhP06909 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CfhP06909 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms