Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb1bP06795 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb1bP06795 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb1bP06795 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms