Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P06344 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06344 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06344 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06344 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06344 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06344 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06344 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P06344 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06344 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P06344 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06344 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06344 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06344 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06344 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06344 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06344 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P06344 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06344 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06344 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06344 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06344 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06344 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06344 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06344 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
P06344 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P06344 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06344 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06344 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06344 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06344 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06344 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06344 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06344 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06344 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06344 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06344 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06344 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06344 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06344 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06344 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06344 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06344 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06344 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06344 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P06344 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P06344 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P06344 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P06344 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06344 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06344 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06344 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06344 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06344 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06344 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06344 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06344 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P06344 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06344 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06344 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P06344 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06344 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06344 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06344 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06344 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06344 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06344 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06344 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06344 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06344 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06344 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06344 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06344 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06344 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06344 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06344 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06344 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06344 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06344 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06344 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P06344 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06344 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06344 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06344 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06344 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06344 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06344 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06344 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06344 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06344 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06344 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06344 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06344 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06344 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06344 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06344 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06344 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06344 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06344 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06344 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms