Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd3dP04235 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd3dP04235 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd3dP04235 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms