Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P04213 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P04213 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P04213 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P04213 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
P04213 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
P04213 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P04213 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P04213 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P04213 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P04213 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P04213 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P04213 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P04213 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P04213 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P04213 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P04213 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P04213 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P04213 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P04213 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P04213 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P04213 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P04213 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P04213 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P04213 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
P04213 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P04213 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P04213 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P04213 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P04213 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P04213 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P04213 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P04213 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P04213 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P04213 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P04213 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P04213 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P04213 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P04213 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P04213 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P04213 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
P04213 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P04213 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P04213 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P04213 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P04213 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P04213 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P04213 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
P04213 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
P04213 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
P04213 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
P04213 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P04213 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P04213 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P04213 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P04213 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P04213 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
P04213 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P04213 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
P04213 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P04213 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
P04213 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
P04213 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
P04213 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
P04213 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
P04213 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
P04213 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P04213 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P04213 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
P04213 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
P04213 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P04213 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P04213 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P04213 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P04213 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P04213 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P04213 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P04213 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P04213 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P04213 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P04213 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
P04213 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P04213 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P04213 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
P04213 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P04213 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms