Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01853 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01853 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01853 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01853 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01853 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01853 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01853 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01853 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01853 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01853 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01853 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01853 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01853 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01853 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01853 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01853 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01853 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01853 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01853 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01853 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01853 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01853 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01853 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01853 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01853 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01853 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01853 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01853 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01853 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01853 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01853 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01853 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01853 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01853 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01853 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01853 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01853 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01853 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01853 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01853 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01853 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01853 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01853 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01853 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01853 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01853 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01853 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01853 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01853 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms