Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01811 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01811 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01811 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01811 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01811 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01811 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01811 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01811 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01811 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01811 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01811 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01811 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01811 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01811 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01811 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01811 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01811 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01811 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01811 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01811 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01811 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01811 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01811 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01811 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01811 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01811 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01811 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01811 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01811 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01811 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01811 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01811 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01811 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01811 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01811 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01811 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01811 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01811 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01811 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01811 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01811 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01811 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01811 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01811 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01811 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01811 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01811 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01811 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01811 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01811 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01811 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01811 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01811 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01811 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01811 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01811 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01811 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01811 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01811 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01811 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01811 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01811 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01811 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01811 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01811 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms