Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01791 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01791 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01791 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01791 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01791 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01791 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01791 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01791 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01791 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01791 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01791 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01791 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01791 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01791 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01791 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01791 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01791 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01791 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01791 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01791 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01791 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01791 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01791 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01791 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01791 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01791 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01791 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01791 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01791 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01791 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01791 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01791 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01791 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01791 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01791 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01791 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01791 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01791 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01791 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01791 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01791 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01791 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01791 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01791 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01791 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01791 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01791 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01791 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01791 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01791 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01791 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01791 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01791 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01791 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01791 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01791 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01791 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01791 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01791 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01791 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01791 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01791 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01791 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01791 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01791 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01791 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01791 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01791 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01791 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01791 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01791 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01791 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01791 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01791 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01791 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01791 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01791 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01791 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01791 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01791 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01791 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01791 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01791 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01791 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms