Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01790 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01790 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01790 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01790 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01790 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01790 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01790 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01790 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01790 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01790 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01790 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01790 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01790 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01790 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01790 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01790 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01790 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01790 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01790 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01790 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01790 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01790 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01790 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01790 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01790 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01790 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01790 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01790 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01790 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01790 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01790 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01790 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01790 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01790 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01790 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01790 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01790 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01790 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01790 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01790 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01790 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01790 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01790 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01790 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01790 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01790 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01790 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01790 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01790 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01790 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01790 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01790 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01790 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01790 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01790 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01790 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01790 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01790 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01790 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01790 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01790 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01790 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01790 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01790 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01790 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01790 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01790 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01790 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01790 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms